RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 OGFRQ9NZT2 677 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 AFF2P51816 1311 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TNS2Q63HR2 1409 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JLW4 131 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CNBD1Q8NA66 436 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf76Q96K31 380 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TSPY26PQ9H489 355 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM37O94972 964 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GUCY2CP25092 1073 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA1LP34931 641 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2HP62256 183 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GPT2Q8TD30 523 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR6Q9Y217 621 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MED23Q9ULK4 1368 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 MRC1P22897 1456 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 COL18A1P39060 1754 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf229H3BNL8 230 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN14P0C7P3 912 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ADD2P35612 726 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 DRC7Q8IY82 874 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C6Q969F1 213 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP45Q9UL16 551 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 STK38Q15208 465 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC6O95255 1503 aa9.09□□□□□ -0.95
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TRPS1-208ENST00000519076 SDF4Q9BRK5 362 aa9.08□□□□□ -0.96
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TRPS1-208ENST00000519076 C5P01031 1676 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.08□□□□□ -0.96
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TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KA4O75676 772 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 SCRN1Q12765 414 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TNMDQ9H2S6 317 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM1O75626 825 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 NTSR2O95665 410 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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TRPS1-208ENST00000519076 UBE3CQ15386 1083 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 MED4Q9NPJ6 270 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 NARFQ9UHQ1 456 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 USP5P45974 858 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 ST5P78524 1137 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.07□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 KINO60870 393 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 CDKL5O76039 1030 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-208ENST00000519076 INCENPQ9NQS7 918 aa9.06□□□□□ -0.96
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