RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516568.1

RNU6-504P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 504, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-504P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-504P-201ENST00000516568 ITGB5P18084 799 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ITPKAP23677 461 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ORC1Q13415 861 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 DYMQ7RTS9 669 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AOC2O75106 756 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ASPAP45381 313 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 SERPINB4P48594 390 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAAP100Q0VG06 881 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 DUSP27Q5VZP5 1158 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 OGFOD3Q6PK18 319 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 SPRED2Q7Z698 418 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FBXL18Q96ME1 805 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM129BQ96TA1 746 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 WDR18Q9BV38 432 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 LGR6Q9HBX8 967 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ABCB6Q9NP58 842 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 U3KQE9 123 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF862O60290 1169 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 RAB6AP20340 208 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 MAP7Q14244 749 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 NPHS2Q9NP85 383 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 DISC1Q9NRI5 854 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 RAD18Q9NS91 495 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 MTMR7Q9Y216 660 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GPR182O15218 404 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMPRSS2O15393 492 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 LIG1P18858 919 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 BNIP3Q12983 259 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PKN1Q16512 942 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TXNDC2Q86VQ3 553 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FLCNQ8NFG4 579 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CORO1BQ9BR76 489 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 EHD4Q9H223 541 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 BRPF3Q9ULD4 1205 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 H3BRB1 525 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 LEFTY1O75610 366 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PAPLNO95428 1278 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CYP27A1Q02318 531 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CDK5R2Q13319 367 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AP3B2Q13367 1082 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GRM2Q14416 872 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PDZD3Q86UT5 571 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 STK35Q8TDR2 534 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CITED4Q96RK1 184 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 OVOL3O00110 214 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 NEFLP07196 543 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CD8BP10966 210 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 CD96P40200 585 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PDE3AQ14432 1141 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF124Q15973 351 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF792Q3KQV3 632 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 PI16Q6UXB8 463 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM214BQ7L5A3 538 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM181AQ8N9Y4 354 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 AGBL5Q8NDL9 886 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-504P-201ENST00000516568 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms