RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502274.1

SH3TC2-202, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3TC2, Length 2,681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2-202ENST00000502274 A0A1B0GUL7 405 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 ATF3P18847 181 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 MAGEA9P43362 315 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 L1RE1Q9UN81 338 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 KIF28PB7ZC32 967 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PTPN21Q16825 1174 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 CHST3Q7LGC8 479 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 NBPF4Q96M43 638 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PHLPP1O60346 1717 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 A0A0G2JLW4 131 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PNOCQ13519 176 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 GCKRQ14397 625 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 CERS3Q8IU89 383 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PDILTQ8N807 584 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 CEP112Q8N8E3 955 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3TC2-202ENST00000502274 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PPP6R2O75170 966 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ERLIN1O75477 346 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 MCM6Q14566 821 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 TUBB2AQ13885 445 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 SHC4Q6S5L8 630 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 CDC23Q9UJX2 597 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PDIA6Q15084 440 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 IP6K1Q92551 441 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 NEXNQ0ZGT2 675 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 JMYQ8N9B5 988 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 BRMS1Q9HCU9 246 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC175P0C221 793 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF18P17022 549 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PNKPQ96T60 521 aa16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 DCCP43146 1447 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PDE4BQ07343 736 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 RESP18Q5W5W9 173 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 DESI2Q9BSY9 194 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 BMP6P22004 513 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ABCB6Q9NP58 842 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PTPAQ15257 358 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC102BQ68D86 513 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PACS2Q86VP3 889 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 FAM71BQ8TC56 605 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 CDC27P30260 824 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 CORO7P57737 925 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PANX2Q96RD6 677 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 MST1RQ04912 1400 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 GOLIM4O00461 696 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 TUBBP07437 444 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 LONRF3Q496Y0 759 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3TC2-202ENST00000502274 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.7 ms