RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284		F6X3S4	739 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	LIG1	P18858	919 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF34	Q969K3	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF862	O60290	1169 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM37	O94972	964 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	GLB1	P16278	677 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	LMNB1	P20700	586 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PWP1	Q13610	501 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284		Q6ZS46	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	AOC2	O75106	756 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PROC	P04070	461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	GATA4	P43694	442 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MSTN	O14793	375 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TIAF1	O95411	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PF4	P02776	101 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	DRD2	P14416	443 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	TCF3	P15923	654 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	LMNB2	Q03252	620 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	RHOV	Q96L33	236 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPRK-215	ENST00000498284	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM23	O75077	832 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ADH5	P11766	374 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PREP	P48147	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SEPT6	Q14141	434 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	USP48	Q86UV5	1035 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF394	Q53GI3	561 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ID3	Q02535	119 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24

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