RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 DRD2P14416 443 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 LRP8Q14114 963 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 NFKBIBQ15653 356 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 KCNB2Q92953 911 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 PIDD1Q9HB75 910 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 CBX8Q9HC52 389 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ARNTP27540 789 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 LRRC14Q15048 493 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 Q8N3U1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 WDR18Q9BV38 432 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ATG3Q9NT62 314 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 CTSBP07858 339 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 USP17L7P0C7H9 530 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 RAB6AP20340 208 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ASPAP45381 313 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ID3Q02535 119 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 NBPF11Q86T75 865 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-241ENST00000496183 COBLO75128 1261 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ECEL1O95672 775 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ARTNQ5T4W7 220 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 SETDB2Q96T68 719 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 LIG1P18858 919 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 LMNB1P20700 586 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 CYP27A1Q02318 531 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 SV2BQ7L1I2 683 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 AK5Q9Y6K8 562 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 WDR64B1ANS9 1081 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 TMPRSS2O15393 492 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PSMD2Q13200 908 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 HOMEZQ8IX15 550 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 FBXL6Q8N531 539 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 MRS2Q9HD23 443 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PICK1Q9NRD5 415 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 TRIM37O94972 964 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 NFICP08651 508 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PDZD3Q86UT5 571 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ENC1O14682 589 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 ZNF862O60290 1169 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 FBXO24O75426 580 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 TGFB1P01137 390 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PIM2Q9P1W9 311 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-241ENST00000496183 RLBP1P12271 317 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 ZAR1Q86SH2 424 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 PARP2Q9UGN5 583 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RBM39-241ENST00000496183 SSTR4P31391 388 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms