RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	AOC2	O75106	756 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ATG7	O95352	703 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	MPST	P25325	297 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CFP	P27918	469 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576		U3KQE9	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	GRIA4	P48058	902 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	MLANA	Q16655	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	AOC3	Q16853	763 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	PRRG2	O14669	202 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	EHHADH	Q08426	723 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	TCF12	Q99081	682 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576	NCAN	O14594	1321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM107B-222	ENST00000488576		A0A1W2PP55	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TSPAN15	O95858	294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	B3GALT4	O96024	378 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	CEACAM5	P06731	702 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	USP5	P45974	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	OXCT1	P55809	520 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	AAMP	Q13685	434 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576		B8ZZF3	427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	LEFTY1	O75610	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	LIG1	P18858	919 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ITIH2	P19823	946 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ID3	Q02535	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	FZD6	O60353	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	NPR3	P17342	541 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	IKZF1	Q13422	519 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ECM1	Q16610	540 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	GJD3	Q8N144	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM13A	O94988	1023 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ITPKA	P23677	461 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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