RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 BTDP43251 543 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 NIM1KQ8IY84 436 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 KCNB2Q92953 911 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF3Q9H094 633 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.55■■□□□ 1.04
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ATG4B-217ENST00000475693 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 CXCL9Q07325 125 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.55■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 ANAPC15P60006 121 aa21.54■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 NFKBIBQ15653 356 aa21.54■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 SHTN1A0MZ66 631 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 TDO2P48775 406 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 RABEP1Q15276 862 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 NAPBQ9H115 298 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 GSTO1P78417 241 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 CHST3Q7LGC8 479 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 GSE1Q14687 1217 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 RNF20Q5VTR2 975 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 JDP2Q8WYK2 163 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 E7EWF7 191 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 CYP2D6P10635 497 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-217ENST00000475693 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.042e-12■■■□□ 18.6
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ATG4B-217ENST00000475693 SOCS7O14512 581 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF213O14771 459 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 CACNB3P54284 484 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 LDHCP07864 332 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 CRKP46108 304 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 RHBDL3P58872 404 aa21.51■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 DTNBO60941 627 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 GAKO14976 1311 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 USP17L12C9JPN9 530 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 USP17L21D6R901 530 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 GNAT2P19087 354 aa21.49■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 USP5P45974 858 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 PPP4CP60510 307 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 CTR9Q6PD62 1173 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 IL17RAQ96F46 866 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 PICALMQ13492 652 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 TEX11Q8IYF3 940 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 TEKT1Q969V4 418 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 NEK1Q96PY6 1258 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.47■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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ATG4B-217ENST00000475693 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 NEDD4P46934 1319 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 SLURP2P0DP57 97 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 AK2P54819 239 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 NFIAQ12857 509 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-217ENST00000475693 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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