RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	DOCK2	Q92608	1830 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	BTD	P43251	543 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	RHBDL3	P58872	404 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	PPP4C	P60510	307 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SNX21-208	ENST00000466252	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	MAP3K12	Q12852	859 aa		28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		28	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	MX1	P20591	662 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TNNI2	P48788	182 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	NFIA	Q12857	509 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	CYP7A1	P22680	504 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	PDE1A	P54750	535 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	FKBP1B	P68106	108 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SNX21-208	ENST00000466252	ERC2	O15083	957 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	ENTPD3	O75355	529 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	BAG3	O95817	575 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PDE6A	P16499	860 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	NF2	P35240	595 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	ADD2	P35612	726 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	RGS3	P49796	1198 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	TCP10	Q12799	353 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	KLRG1	Q96E93	195 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	CHGB	P05060	677 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	HUNK	P57058	714 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PLCG2	P16885	1265 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MYH7	P12883	1935 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PDE4A	P27815	886 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	PRKG1	Q13976	671 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.06
SNX21-208	ENST00000466252	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	VEGFB	P49765	207 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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