RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.24■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 NEDD4P46934 1319 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 FAM177BA6PVY3 158 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 PFKFB1P16118 471 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A14Q15043 492 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.23■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 KRT40Q6A162 431 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.23■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.23■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 CDC27P30260 824 aa21.23■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.23■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 C4BP0C0L5 1744 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 ALX1Q15699 326 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 DISP2A7MBM2 1401 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 MBD4O95243 580 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 SKILP12757 684 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 LY9Q9HBG7 655 aa21.22■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.22■□□□□ 0.99
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SYNE4-204ENST00000465425 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 RASGRF1Q13972 1273 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 ARID5BQ14865 1188 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 SENP2Q9HC62 589 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC69A6NI79 296 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 NUP98P52948 1817 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNE4-204ENST00000465425 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 LIFRP42702 1097 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SYKP43405 635 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 GSDMDP57764 484 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP12P59046 1061 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 MYL10Q9BUA6 226 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SMTNL1A8MU46 457 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 PPP6R2O75170 966 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 ARMT1Q9H993 441 aa21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.19■□□□□ 0.98
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SYNE4-204ENST00000465425 KRT23Q9C075 422 aa21.19■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 INCENPQ9NQS7 918 aa21.19■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.19■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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SYNE4-204ENST00000465425 SUSD4Q5VX71 490 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 TIGD1Q96MW7 591 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SNAP23O00161 211 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 TOMM22Q9NS69 142 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 STRCQ7RTU9 1775 aa21.18■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 LRP5O75197 1615 aa21.17■□□□□ 0.98
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SYNE4-204ENST00000465425 WASF1Q92558 559 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 GNAT2P19087 354 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CEP135Q66GS9 1140 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF592Q92610 1267 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCZ1BP86790 482 aa21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SYNE4-204ENST00000465425 PTPN14Q15678 1187 aa21.16■□□□□ 0.98
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