RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	CHGB	P05060	677 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	USP5	P45974	858 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TNNI2	P48788	182 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CACNB3	P54284	484 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PICALM	Q13492	652 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZNF384	Q8TF68	577 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	GGA3	Q9NZ52	723 aa		10.07	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	HIP1	O00291	1037 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TOMM70	O94826	608 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PLCG2	P16885	1265 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PPP4C	P60510	307 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TCP10	Q12799	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	APPBP2	Q92624	585 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	GAK	O14976	1311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	MBD4	O95243	580 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	APP	P05067	770 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.05	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	RHBDL3	P58872	404 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	RASA3	Q14644	834 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CERS3	Q8IU89	383 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	FAM227B	Q96M60	508 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710		M0R2C6	588 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	TRAF5	O00463	557 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PRKAB2	O43741	272 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	NF2	P35240	595 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	NFIA	Q12857	509 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	PRKG1	Q13976	671 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
IL6-208	ENST00000464710	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GPAA1	O43292	621 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ENTPD3	O75355	529 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GNAT2	P19087	354 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CHML	P26374	656 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.02	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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