RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 TEPSINQ96N21 525 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 HAUS7Q99871 368 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 USP40Q9NVE5 1235 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 BTDP43251 543 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM83AQ86UY5 434 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 KLRG1Q96E93 195 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 PCNTO95613 3336 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 GOLIM4O00461 696 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 TNNI2P48788 182 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 RHBDL3P58872 404 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 NFIAQ12857 509 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.09■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 FKBP1BP68106 108 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RPUSD3-210ENST00000460909 MAP3K12Q12852 859 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MOB2Q70IA6 237 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 GPATCH3Q96I76 525 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 IDI2Q9BXS1 227 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.07■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 NF2P35240 595 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 HUNKP57058 714 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP4CP60510 307 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.06■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MX1P20591 662 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP7A1P22680 504 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 NUCB1Q02818 461 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM151AQ8WW52 585 aa25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 VEGFBP49765 207 aa25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 LNPKQ9C0E8 428 aa25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 FZD1Q9UP38 647 aa25.04■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 RGS3P49796 1198 aa25.03■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 TCP10Q12799 353 aa25.03■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.03■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 STAP2Q9UGK3 403 aa25.03■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 ENTPD3O75355 529 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 PDE6AP16499 860 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MAP3K11Q16584 847 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 MYH7P12883 1935 aa25.02■■□□□ 1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 BAG3O95817 575 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 PRKG1Q13976 671 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 JMYQ8N9B5 988 aa25.01■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 FOCADQ5VW36 1801 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 ERC2O15083 957 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 PDE1AP54750 535 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 RGMBQ6NW40 437 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 MIGA1Q8NAN2 632 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 CAPNS2Q96L46 248 aa25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 PLCG2P16885 1265 aa24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 ADD2P35612 726 aa24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.99■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.98■■□□□ 1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 CHGBP05060 677 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms