RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB43O43298 467 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 VPS37DQ86XT2 251 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MYL10Q9BUA6 226 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MBD4O95243 580 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K12Q12852 859 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 RASGRF1Q13972 1273 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 KRT40Q6A162 431 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 NAPBQ9H115 298 aa23.75■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 BIN1O00499 593 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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IMP4-208ENST00000460766 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 SUSD4Q5VX71 490 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 LY9Q9HBG7 655 aa23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 CMA1P23946 247 aa23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 SLC39A14Q15043 492 aa23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 ARMT1Q9H993 441 aa23.73■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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IMP4-208ENST00000460766 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 STRCQ7RTU9 1775 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 TNNT1P13805 278 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 NEMFO60524 1076 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 TRIM29Q14134 588 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 ALX1Q15699 326 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 MYH3P11055 1940 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.72■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 C4AP0C0L4 1744 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 C4BP0C0L5 1744 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 SKILP12757 684 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 RGS22Q8NE09 1264 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 AK7Q96M32 723 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-208ENST00000460766 CCDC69A6NI79 296 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 NTRK3Q16288 839 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 TOMM22Q9NS69 142 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 NUP98P52948 1817 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SYKP43405 635 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SLIT2O94813 1529 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 PRKAB2O43741 272 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 BCAMP50895 628 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 NLRP12P59046 1061 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 ISM2Q6H9L7 571 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 JMYQ8N9B5 988 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SMC2O95347 1197 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 LIFRP42702 1097 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 TDO2P48775 406 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 LRP5O75197 1615 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 PPP6R2O75170 966 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 LCORLQ8N3X6 602 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 KRT23Q9C075 422 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.67■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1AP38606 617 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 TPM4P67936 248 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 PTPAQ15257 358 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SHC4Q6S5L8 630 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 NBPF11Q86T75 865 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 USP27XA6NNY8 438 aa23.66■■□□□ 1.38
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