RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDKL5O76039 1030 aa20.38■□□□□ 0.85
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.38■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.38■□□□□ 0.85
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPR1P16066 1061 aa20.37■□□□□ 0.85
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LTBP1Q14766 1721 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC69A6NI79 296 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APOA5Q6Q788 366 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LY9Q9HBG7 655 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBTB43O43298 467 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RESTQ13127 1097 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMTC2Q8N394 836 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ESR2Q92731 530 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD209Q9NNX6 404 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ELP1O95163 1332 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LDHCP07864 332 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MMP10P09238 476 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL1R1P14778 569 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALDH1B1P30837 517 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.36■□□□□ 0.85
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