RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 BRAPQ7Z569 592 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CPS1P31327 1500 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SHPRHQ149N8 1683 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CALM1P0DP23 149 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CALM2P0DP24 149 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CALM3P0DP25 149 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL5Q02045 173 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 LINS1Q8NG48 757 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1524Q8TCG1 905 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNDC16Q9P2K2 825 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM23A6NLE4 172 aa12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf34Q49A92 452 aa12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 KSR2Q6VAB6 950 aa12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD15Q9P1V8 674 aa12.4□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SETDB1Q15047 1291 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM76AQ8TAV0 307 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPDC1A2A3K4 754 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R3AQ06190 1150 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC25Q86WR0 208 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 DCTPP1Q9H773 170 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC4P43686 418 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC122Q5T0U0 273 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF4Q96M43 638 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 METP08581 1390 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 EVCP57679 992 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC16Q8NEE8 873 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PAG1Q9NWQ8 432 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC4Q9UJX5 808 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 HDXQ7Z353 690 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 OGFRQ9NZT2 677 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNI2P48788 182 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 DTHD1Q6ZMT9 781 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ERO1AQ96HE7 468 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP1Q9C000 1473 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ATL3Q6DD88 541 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TNRQ92752 1358 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 GNA11P29992 359 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NGLY1Q96IV0 654 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TECPR2O15040 1411 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 23.1
EFTUD2-202ENST00000426333 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBRQ0VD83 1088 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB9Q96C00 473 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP3Q96P20 1036 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM13AO94988 1023 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 INF2Q27J81 1249 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST3Q7LGC8 479 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ACEP12821 1306 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH3A1P30838 453 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF4Q9H2L5 321 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAT2P19087 354 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R7Q15435 360 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C6Q969F1 213 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL13P26373 211 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RFC4P35249 363 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP6Q6ZN66 633 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRUQ92729 1446 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL9Q8NET4 1388 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT2P35908 639 aa12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms