RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415017.1

CNN3-203, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-203ENST00000415017 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 F8W031 263 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 LCORLQ8N3X6 602 aa15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.97■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 ZMYM6O95789 1325 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 SHTN1A0MZ66 631 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 MBD4O95243 580 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 SPDYE6P0CI01 402 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 BTDP43251 543 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 ALX1Q15699 326 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 CFAP100Q494V2 611 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 OGFOD1Q8N543 542 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 MAP4K1Q92918 833 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 ARMT1Q9H993 441 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.96■□□□□ 0.15
CNN3-203ENST00000415017 LAMB1P07942 1786 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 POTECB2RU33 542 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 BAG3O95817 575 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 GNAT2P19087 354 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 MICALL2Q8IY33 904 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 AIDAQ96BJ3 306 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 IDI2Q9BXS1 227 aa15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 EGFRP00533 1210 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 PLCG2P16885 1265 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 PTH1RQ03431 593 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 VPS53Q5VIR6 699 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 USP26Q9BXU7 913 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SIPA1L1O43166 1804 aa15.94■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 WNT10BO00744 389 aa15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 REC8O95072 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 EPS15P42566 896 aa15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 KCNB2Q92953 911 aa15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 IL17RAQ96F46 866 aa15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 H7C1D1 291 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 PRKAB2O43741 272 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 NECTIN1Q15223 517 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 DLGAP5Q15398 846 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa15.92■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 USP40Q9NVE5 1235 aa15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.91■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 FGAP02671 866 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SBK1Q52WX2 424 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SDR42E1Q8WUS8 393 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.9■□□□□ 0.14
CNN3-203ENST00000415017 CNTNAP1P78357 1384 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 ENTPD3O75355 529 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 HSPA4P34932 840 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 NFIAQ12857 509 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 FAM83AQ86UY5 434 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 TEX11Q8IYF3 940 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 HACL1Q9UJ83 578 aa15.89■□□□□ 0.13
CNN3-203ENST00000415017 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms