RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LHX6Q9UPM6 363 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC12Q96J65 1359 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE6AP16499 860 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL9Q8NET4 1388 aa4.71□□□□□ -1.65
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH3P11055 1940 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXP2O15409 715 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 EVI5O60447 810 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GYG1P46976 350 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K12Q12852 859 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE3CQ15386 1083 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM205CA6NFA0 338 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF213O14771 459 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM37O94972 964 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBRQ0VD83 1088 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS37DQ86XT2 251 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 AIDAQ96BJ3 306 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCF2Q9UG63 623 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 F13A1P00488 732 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GPT2Q8TD30 523 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MTMR6Q9Y217 621 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ATRNO75882 1429 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 JAK2O60674 1132 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP2K5Q13163 448 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE4AQ14139 1066 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 HIC1Q14526 733 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 USP48Q86UV5 1035 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FERMT3Q86UX7 667 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C6Q969F1 213 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX11Q96FC9 970 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RREB1Q92766 1687 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 BTAF1O14981 1849 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PPFIA3O75145 1194 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD4O95243 580 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SCRN1Q12765 414 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NFIXQ14938 502 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMT1Q9H993 441 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 SPEF2Q9C093 1822 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 EP400Q96L91 3159 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FSD2A1L4K1 749 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FIBPO43427 364 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PDCP20941 246 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K9P80192 1104 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TRDNQ13061 729 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NCOA7Q8NI08 942 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 RAI14Q9P0K7 980 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PRC1O43663 620 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAB2O43741 272 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 PFKFB2O60825 505 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP7A1P22680 504 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRK1P26718 216 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 MCM5P33992 734 aa4.69□□□□□ -1.66
LRRTM4-201ENST00000409088 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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