RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 DESI2Q9BSY9 194 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC175P0C221 793 aa25.03■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 LTKP29376 864 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 NLRP6P59044 892 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 GBP3Q9H0R5 595 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CLDN5-201ENST00000403084 PPP6R2O75170 966 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CASP8Q14790 479 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 SHC4Q6S5L8 630 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 MED4Q9NPJ6 270 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 A0A0G2JLW4 131 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 IGKV5-2P06315 115 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF18P17022 549 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 TFCP2Q12800 502 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CHST3Q7LGC8 479 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PDE4BQ07343 736 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CNNM3Q8NE01 707 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 TUBBP07437 444 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 TICAM2Q86XR7 235 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 EFCAB13Q8IY85 973 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PANX2Q96RD6 677 aa24.99■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PPFIA4O75335 1185 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 BMP6P22004 513 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 RESP18Q5W5W9 173 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 EID1Q9Y6B2 187 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 KIF5CO60282 957 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CDC27P30260 824 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 VSNL1P62760 191 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 MTF1Q14872 753 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 JMYQ8N9B5 988 aa24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 RAI14Q9P0K7 980 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PTPAQ15257 358 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC102AQ96A19 550 aa24.97■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DRC1Q96MC2 740 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DEF6Q9H4E7 631 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 C4AP0C0L4 1744 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 C4BP0C0L5 1744 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC102BQ68D86 513 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.96■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.95■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
CLDN5-201ENST00000403084 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NR1I3Q14994 352 aa24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 LONRF3Q496Y0 759 aa24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.95■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 GCKRQ14397 625 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 LTN1O94822 1766 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MMP14P50281 582 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.94■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms