RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 TXNRD1Q16881 649 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CACNA1SQ13698 1873 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PLSCR1O15162 318 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MBD4O95243 580 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PRR5LQ6MZQ0 368 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NAPBQ9H115 298 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINB2P05120 415 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TM4SF1P30408 202 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 HAND2P61296 217 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 STK3Q13188 491 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 RAI14Q9P0K7 980 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ABCF2Q9UG63 623 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 XDHP47989 1333 aa13.12□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PRC1O43663 620 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CYP7A1P22680 504 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 EVCP57679 992 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CRY2Q49AN0 593 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CNNM2Q9H8M5 875 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MTMR6Q9Y217 621 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC37AA6NMS7 1700 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SNPHO15079 494 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TDO2P48775 406 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TMC4Q7Z404 712 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC2Q9BYS8 371 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ARMT1Q9H993 441 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 RXRBP28702 533 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 APOBRQ0VD83 1088 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SCRN1Q12765 414 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM87BQ96K49 555 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 KRT23Q9C075 422 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LAMB1P07942 1786 aa13.1□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0G2JLW4 131 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 LCORLQ8N3X6 602 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-202ENST00000395322 FSD2A1L4K1 749 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 G3V3G9 751 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 H3BQV1 296 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 BBOX1O75936 387 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 APBA3O96018 575 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 KRT85P78386 507 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 IFFO2Q5TF58 517 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-202ENST00000395322 MTA3Q9BTC8 594 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms