RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394011.7

RALGPS1-206, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-206ENST00000394011 CAP1Q01518 475 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 CRHR2Q13324 411 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 MTX1Q13505 466 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 GNAI2P04899 355 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 MS4A1P11836 297 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 CCDC102BQ68D86 513 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 PANK1Q8TE04 598 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 SEMA3EO15041 775 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 NFIAQ12857 509 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 CENPFP49454 3210 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-206ENST00000394011 SRGAP3O43295 1099 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 TIMM10P62072 90 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 FAM151AQ8WW52 585 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 OTUD5Q96G74 571 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 WRNIP1Q96S55 665 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 CSADQ9Y600 493 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 RASGRF1Q13972 1273 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 AK9Q5TCS8 1911 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 GTF2A2P52657 109 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 TFCP2Q12800 502 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 CCL15Q16663 113 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 TRIM17Q9Y577 477 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 A0A1B0GUL7 405 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ERO1BQ86YB8 467 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 XAGE2Q96GT9 111 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 GAKO14976 1311 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 DOCK2Q92608 1830 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 BRCA2P51587 3418 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 IRF6O14896 467 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 INPP5BP32019 993 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 TCP10Q12799 353 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 HOOK2Q96ED9 719 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 SP3Q02447 781 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 DCAF15Q66K64 600 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF384Q8TF68 577 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 ERO1AQ96HE7 468 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 USP40Q9NVE5 1235 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-206ENST00000394011 PPIL2Q13356 520 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 IDI2Q9BXS1 227 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 COG6Q9Y2V7 657 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 BTBD19C9JJ37 291 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 PPATQ06203 517 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 CETPP11597 493 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ATP8B2P98198 1209 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 SNAPC2Q13487 334 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 MOGSQ13724 837 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 EFCC1Q9HA90 598 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ABCF2Q9UG63 623 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-206ENST00000394011 ENTPD3O75355 529 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms