RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	WNT10B	O00744	389 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	EGFR	P00533	1210 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	BTD	P43251	543 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	CEP350	Q5VT06	3117 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	PLCG2	P16885	1265 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP4C	P60510	307 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GKAP1-204	ENST00000388782	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	CHGB	P05060	677 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	AIDA	Q96BJ3	306 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	OSBP2	Q969R2	916 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	USP40	Q9NVE5	1235 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	LDHD	Q86WU2	507 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	GGA3	Q9NZ52	723 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	MBD4	O95243	580 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	CHML	P26374	656 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	RHBDL3	P58872	404 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	CASC1	Q6TDU7	716 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A0D9SFI3	127 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CLRN2	A0PK11	232 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CDC45	O75419	566 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM227B	Q96M60	508 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	RAD50	Q92878	1312 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782		M0R2C6	588 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	LCORL	Q8N3X6	602 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	VEZT	Q9HBM0	779 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	GPAA1	O43292	621 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	IFFO2	Q5TF58	517 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	IDI2	Q9BXS1	227 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	GNAT2	P19087	354 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	FSTL1	Q12841	308 aa		29.73	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	TNNI2	P48788	182 aa		29.72	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEI	P0CG38	1075 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	POTEJ	P0CG39	1038 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	SULF1	Q8IWU6	871 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CACNB3	P54284	484 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		29.7	■■■□□ 2.35
GKAP1-204	ENST00000388782	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		29.7	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	ENTPD3	O75355	529 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	USP5	P45974	858 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	NFIA	Q12857	509 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	FLT1	P17948	1338 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	PICALM	Q13492	652 aa		29.67	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	CHADL	Q6NUI6	762 aa		29.67	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		29.67	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.67	■■■□□ 2.34
GKAP1-204	ENST00000388782	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		29.67	■■■□□ 2.34

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