RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 IL25Q9H293 177 aa28.38■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 HACL1Q9UJ83 578 aa28.38■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.37■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 WNT10BO00744 389 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 FOCADQ5VW36 1801 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 PPP4CP60510 307 aa28.36■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 MBD4O95243 580 aa28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 RHBDL3P58872 404 aa28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 LCORLQ8N3X6 602 aa28.35■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 EPHX2P34913 555 aa28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 ARMT1Q9H993 441 aa28.34■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 BAG3O95817 575 aa28.33■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 AIDAQ96BJ3 306 aa28.33■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 RRAGCQ9HB90 399 aa28.33■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PDSS1-201ENST00000376215 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 GPAA1O43292 621 aa28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 USP40Q9NVE5 1235 aa28.32■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.3■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.3■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.3■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 RAD50Q92878 1312 aa28.3■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 CLRN2A0PK11 232 aa28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 SGSM2O43147 1006 aa28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 PLCG2P16885 1265 aa28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 CACNB3P54284 484 aa28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 CASC1Q6TDU7 716 aa28.29■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 PRKAB2O43741 272 aa28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 CERS3Q8IU89 383 aa28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 TEX11Q8IYF3 940 aa28.28■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 MYO1BO43795 1136 aa28.27■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 NFIAQ12857 509 aa28.27■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 C8orf34Q49A92 452 aa28.27■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.27■■■□□ 2.12
PDSS1-201ENST00000376215 FOXP2O15409 715 aa28.26■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 VPS53Q5VIR6 699 aa28.26■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 GGA3Q9NZ52 723 aa28.25■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 MYH1P12882 1939 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 POTEIP0CG38 1075 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 POTEJP0CG39 1038 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 YY1P25490 414 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 IDI2Q9BXS1 227 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 VEZTQ9HBM0 779 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.23■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 GNAT2P19087 354 aa28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 PICALMQ13492 652 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 FLT1P17948 1338 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 CNTNAP1P78357 1384 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 USP5P45974 858 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PDSS1-201ENST00000376215 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PDSS1-201ENST00000376215 PTH1RQ03431 593 aa28.2■■■□□ 2.1
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