RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ITGB5P18084 799 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ORC1Q13415 861 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 COL19A1Q14993 1142 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ABCB6Q9NP58 842 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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PTPRK-202ENST00000368205 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRK-202ENST00000368205 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 MISP3Q96FF7 219 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRK-202ENST00000368205 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRK-202ENST00000368205 PLCL1Q15111 1095 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PDZD3Q86UT5 571 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRK-202ENST00000368205 C8AP07357 584 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRK-202ENST00000368205 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 BNIP3Q12983 259 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 NEFMP07197 916 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 CD8BP10966 210 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-24P63145 666 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 PDE4CQ08493 712 aa7.95□□□□□ -1.14
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