RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366973.8

TATDN3-201, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-201ENST00000366973 NPHP1O15259 732 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 KDM4AO75164 1064 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 C8orf76Q96K31 380 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TMEM87BQ96K49 555 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 C4AP0C0L4 1744 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 C4BP0C0L5 1744 aa16.94■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 LY75O60449 1722 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 KLRK1P26718 216 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 APOA5Q6Q788 366 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MICU3Q86XE3 530 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 USP28Q96RU2 1077 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 SBF2Q86WG5 1849 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TOMM22Q9NS69 142 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.93■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 NR1I2O75469 434 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RFC4P35249 363 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MAP3K11Q16584 847 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 LY9Q9HBG7 655 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RXRBP28702 533 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CLCN1P35523 988 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MYL10Q9BUA6 226 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TNMDQ9H2S6 317 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC192P0DO97 292 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 KRT23Q9C075 422 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CACNA1SQ13698 1873 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ZBTB43O43298 467 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CDC27P30260 824 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 UVSSAQ2YD98 709 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.91■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ATL3Q6DD88 541 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 KLHL34Q8N239 644 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 USP25Q9UHP3 1055 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 AIFM3Q96NN9 605 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.9■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 LIFRP42702 1097 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 PPARAQ07869 468 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 PHKBQ93100 1093 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC69A6NI79 296 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 CDKL5O76039 1030 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 TM4SF1P30408 202 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF384Q8TF68 577 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 HS1BP3Q53T59 392 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 ALG1Q9BT22 464 aa16.88■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 ME1P48163 572 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 TYRO3Q06418 890 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 NFIXQ14938 502 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 EP400Q96L91 3159 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 KIF28PB7ZC32 967 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 SMIM22K7EJ46 135 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 SEMA3EO15041 775 aa16.87■□□□□ 0.29
TATDN3-201ENST00000366973 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms