RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348225.6

PTN-201, Transcript of pleiotrophin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTN, Length 1,614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTN-201ENST00000348225 MCM5P33992 734 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 GTF2IP78347 998 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 NUCB2P80303 420 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.09■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 ME3Q16798 604 aa22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 PODNQ7Z5L7 613 aa22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 NBPF3Q9H094 633 aa22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.08■■□□□ 1.13
PTN-201ENST00000348225 SNED1Q8TER0 1413 aa22.08■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.08■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.08■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 LARGE1O95461 756 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 DPEP1P16444 411 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 TGFB2P61812 414 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 DOK7Q18PE1 504 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 FBXL16Q8N461 479 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.07■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PTN-201ENST00000348225 CCDC93Q567U6 631 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 BRF1Q92994 677 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 FBXW7Q969H0 707 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 PRC1O43663 620 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 C21orf2O43822 256 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 PPP4CP60510 307 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 GRIK5Q16478 980 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.06■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 PPARAQ07869 468 aa22.05■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.05■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.05■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 KRT23Q9C075 422 aa22.05■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.05■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 NFKBIBQ15653 356 aa22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 SOGA3Q5TF21 947 aa22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 LAMB1P07942 1786 aa22.04■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 PLCG2P16885 1265 aa22.03■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 KCNA3P22001 575 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTN-201ENST00000348225 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.03■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.03■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.03■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PTN-201ENST00000348225 NBR1Q14596 966 aa22.02■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 CHST3Q7LGC8 479 aa22.02■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.02■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 NEDD4P46934 1319 aa22.02■■□□□ 1.12
PTN-201ENST00000348225 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTN-201ENST00000348225 USP5P45974 858 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 NECAB1Q8N987 351 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 GTF3C6Q969F1 213 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 PSMD1Q99460 953 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 PIM2Q9P1W9 311 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 GAKO14976 1311 aa22.02■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 B4E1Z4 1266 aa22.01■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 ANTXR2P58335 489 aa22.01■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 AOC3Q16853 763 aa22.01■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTN-201ENST00000348225 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 TMEM87BQ96K49 555 aa22.01■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 PPIP5K2O43314 1243 aa22■■□□□ 1.11
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PTN-201ENST00000348225 ST3GAL1Q11201 340 aa22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 STK3Q13188 491 aa22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 SBK1Q52WX2 424 aa22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 CTR9Q6PD62 1173 aa22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 NAV1Q8NEY1 1877 aa22■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 PFKFB2O60825 505 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 EVCP57679 992 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 CERS5Q8N5B7 392 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 GBP4Q96PP9 640 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 TOMM22Q9NS69 142 aa21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 USP17L12C9JPN9 530 aa21.98■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 USP17L21D6R901 530 aa21.98■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.98■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 MTA3Q9BTC8 594 aa21.98■■□□□ 1.11
PTN-201ENST00000348225 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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