RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.2■■□□□ 1.47
KCNQ1-202ENST00000335475 INCENPQ9NQS7 918 aa24.2■■□□□ 1.47
KCNQ1-202ENST00000335475 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 ADALQ6DHV7 355 aa24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 LCORLQ8N3X6 602 aa24.2■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.2■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 NID2Q14112 1375 aa24.19■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 CAVIN2O95810 425 aa24.19■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.19■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.18■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.18■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.18■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 CDKL5O76039 1030 aa24.17■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.17■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.17■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 GNAT2P19087 354 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 STK38Q15208 465 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 ERFEQ4G0M1 354 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
KCNQ1-202ENST00000335475 SPC24Q8NBT2 197 aa24.16■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 SPTLC2O15270 562 aa24.15■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF75DP51815 510 aa24.15■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.15■■□□□ 1.46
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KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFA8P51970 172 aa24.14■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT40Q6A162 431 aa24.14■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GVL5 298 aa24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT23Q9C075 422 aa24.13■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.13■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.13■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 RGL2O15211 777 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 TDO2P48775 406 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE4AQ14139 1066 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 SARM1Q6SZW1 724 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.12■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.11■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.11■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A087WWV3 80 aa24.1■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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KCNQ1-202ENST00000335475 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.1■■□□□ 1.45
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.1■■□□□ 1.45
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