RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 BBOX1O75936 387 aa21.05■□□□□ 0.96
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ACTB-201ENST00000331789 SP8Q8IXZ3 490 aa20.98■□□□□ 0.95
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ACTB-201ENST00000331789 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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ACTB-201ENST00000331789 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.97■□□□□ 0.95
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ACTB-201ENST00000331789 LIFRP42702 1097 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.958e-18■□□□□ 9.9
ACTB-201ENST00000331789 ZNF445P59923 1031 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.96■□□□□ 0.95
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