RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 PLXNC1O60486 1568 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP157Q5JU67 520 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 BTG4Q9NY30 223 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM75PA6NK02 468 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 STMN2Q93045 179 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 IFNKQ9P0W0 207 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CHL1O00533 1208 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 GNAQP50148 359 aa18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 STX17P56962 302 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 NYXQ9GZU5 481 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CALCOCO2Q13137 446 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CHMLP26374 656 aa18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 GTF3C6Q969F1 213 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 LGR6Q9HBX8 967 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 NAPAP54920 295 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 TRAF1Q13077 416 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CIB2O75838 187 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 FAM13AO94988 1023 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.72■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 A0A1B0GUL7 405 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 MBD5Q9P267 1494 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 ABCA8O94911 1581 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.71■□□□□ 0.59
LRRC3-201ENST00000291592 A0A1B0GUA9 196 aa18.71■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.71■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.71■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.71■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 TCHPQ9BT92 498 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SEC24BO95487 1268 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 AK2P54819 239 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 KRT79Q5XKE5 535 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 IFT74Q96LB3 600 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 HOXB7P09629 217 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 ATP11AP98196 1134 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 EVCP57679 992 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 DPH6Q7L8W6 267 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 C6orf50Q9HD87 102 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 F8W031 263 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 GMNNO75496 209 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC14Q49A88 953 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CNGA4Q8IV77 575 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 USP19O94966 1318 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 USP26Q9BXU7 913 aa18.69■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 KIF3CO14782 793 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CALM1P0DP23 149 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CALM2P0DP24 149 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CALM3P0DP25 149 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 ARHGEF10O15013 1369 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 ATP5DP30049 168 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SNX16P57768 344 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 RAD50Q92878 1312 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CHST3Q7LGC8 479 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.68■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 PCK1P35558 622 aa18.67■□□□□ 0.58
LRRC3-201ENST00000291592 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms