RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA1FO60840 1977 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMARCE1-201ENST00000264640 NF2P35240 595 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 PDIA6Q15084 440 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMARCE1-201ENST00000264640 SMC5Q8IY18 1101 aa8.66□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.65□□□□□ -1.02
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SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL11AQ9H165 835 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.65□□□□□ -1.02
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SMARCE1-201ENST00000264640 MYH3P11055 1940 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 PROX2Q3B8N5 592 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 LRCH3Q96II8 777 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 WNK4Q96J92 1243 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 TNNQ9UQP3 1299 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L4A6NCW7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.63□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT10BO00744 389 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 NUCB1Q02818 461 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 SHISA4Q96DD7 197 aa8.62□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN18Q99952 460 aa8.62□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.62□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A3P48751 1232 aa8.61□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.61□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 NBPF11Q86T75 865 aa8.61□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 PRO3102Q9H379 93 aa8.61□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.6□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 MTFR1Q15390 333 aa8.6□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 DACT2Q5SW24 774 aa8.6□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 OGFOD1Q8N543 542 aa8.6□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GUL6 1792 aa8.6□□□□□ -1.03
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SMARCE1-201ENST00000264640 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 HMMRO75330 724 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 BCAMP50895 628 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT24Q2M2I5 525 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 Q7L0L9 218 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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