RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 G3V3G9 751 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 LARGE1O95461 756 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 GSTO1P78417 241 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 NCOA7Q8NI08 942 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 ZNF384Q8TF68 577 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.84□□□□□ -0.83
COPS4-201ENST00000264389 SNED1Q8TER0 1413 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 PRKAB2O43741 272 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ZBTB7AO95365 584 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 POLD1P28340 1107 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TRDNQ13061 729 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NBR1Q14596 966 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 Q6ZUG5 572 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 FBXW7Q969H0 707 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MTFR1LQ9H019 292 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NBPF3Q9H094 633 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MYH6P13533 1939 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 LDHCP07864 332 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MCM5P33992 734 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 GTF2IP78347 998 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NUCB2P80303 420 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ME3Q16798 604 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 BRF1Q92994 677 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NEDD4P46934 1319 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 PRC1O43663 620 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NFKBIBQ15653 356 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 GRIK5Q16478 980 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 DOK7Q18PE1 504 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 SLF2Q8IX21 1173 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TTLL6Q8N841 843 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 C21orf2O43822 256 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 BAG3O95817 575 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 DPEP1P16444 411 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TCHHQ07283 1943 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 PPARAQ07869 468 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 STK3Q13188 491 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CCDC93Q567U6 631 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CHST3Q7LGC8 479 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 CERS3Q8IU89 383 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 KRT23Q9C075 422 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 B4E1Z4 1266 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ECE2O60344 883 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 BTDP43251 543 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 APOBRQ0VD83 1088 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ST3GAL1Q11201 340 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 PODNQ7Z5L7 613 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 NECAB1Q8N987 351 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 TOMM22Q9NS69 142 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
COPS4-201ENST00000264389 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms