RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 KDM4AO75164 1064 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 GYS1P13807 737 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 TYRO3Q06418 890 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 SENP2Q9HC62 589 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CASZ1Q86V15 1759 aa21.9■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MBD4O95243 580 aa21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 NEDD4P46934 1319 aa21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 RXRAP19793 462 aa21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ARMT1Q9H993 441 aa21.89■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 B4E1Z4 1266 aa21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CHRNDQ07001 517 aa21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 TRDNQ13061 729 aa21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.87■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.87■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 PRKAB2O43741 272 aa21.86■■□□□ 1.09
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PDLIM4-201ENST00000253754 MAP3K12Q12852 859 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF827Q17R98 1081 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CPLX1O14810 134 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CNBD1Q8NA66 436 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 C8orf76Q96K31 380 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.86■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 LUZP1Q86V48 1076 aa21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.85■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 KLHL34Q8N239 644 aa21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 LCORLQ8N3X6 602 aa21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 AIFM3Q96NN9 605 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 MYL10Q9BUA6 226 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 AKT1S1Q96B36 256 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 NAPBQ9H115 298 aa21.83■■□□□ 1.09
PDLIM4-201ENST00000253754 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF28PB7ZC32 967 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ME1P48163 572 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 MICU3Q86XE3 530 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 UTRNP46939 3433 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 CDC27P30260 824 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TM4SF1P30408 202 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 CBX8Q9HC52 389 aa21.82■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ZMYM6O95789 1325 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 OFD1O75665 1012 aa21.81■■□□□ 1.08
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PDLIM4-201ENST00000253754 GYG1P46976 350 aa21.81■■□□□ 1.08
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PDLIM4-201ENST00000253754 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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PDLIM4-201ENST00000253754 ALX1Q15699 326 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 PHKBQ93100 1093 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.81■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 LY9Q9HBG7 655 aa21.8■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.8■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 DOCK2Q92608 1830 aa21.8■■□□□ 1.08
PDLIM4-201ENST00000253754 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.8■■□□□ 1.08
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