RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238091.8

ITGB1BP1-201, Transcript of integrin subunit beta 1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ITGB1BP1, Length 1,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 YDJCA8MPS7 323 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SPON1Q9HCB6 807 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GAKO14976 1311 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DACT2Q5SW24 774 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L3A6NCW0 530 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L4A6NCW7 530 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TDO2P48775 406 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 VPS33BQ9H267 617 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 F8W031 263 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BAG3O95817 575 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BTDP43251 543 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CUL4AQ13619 759 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 INCENPQ9NQS7 918 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SCN9AQ15858 1988 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 COL4A5P29400 1685 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SMIM22K7EJ46 135 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DDIT3P35638 169 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CTR9Q6PD62 1173 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SLF2Q8IX21 1173 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 BCS1LQ9Y276 419 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGB1BP1-201ENST00000238091 RHBDL3P58872 404 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 Q6ZUG5 572 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NFKBIEO00221 500 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LARGE1O95461 756 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SCNN1DP51172 638 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PPARAQ07869 468 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NCOA7Q8NI08 942 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L12C9JPN9 530 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L21D6R901 530 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ANTXR2P58335 489 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CHST3Q7LGC8 479 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 STAG1Q8WVM7 1258 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MRIQ9BWK5 157 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 AGXT2Q9BYV1 514 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 LAMA4Q16363 1823 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 NEDD4P46934 1319 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 EVX2Q03828 476 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ANKRD1Q15327 319 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ME3Q16798 604 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 SBK1Q52WX2 424 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CERS3Q8IU89 383 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TAOK3Q9H2K8 898 aa16■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP5P45974 858 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 FBXL16Q8N461 479 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 B4E1Z4 1266 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 USP17L8P0C7I0 530 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 CYP2D6P10635 497 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 PLCG2P16885 1265 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 MCM5P33992 734 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 ST3GAL1Q11201 340 aa15.98■□□□□ 0.15
ITGB1BP1-201ENST00000238091 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms