RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 KIF28PB7ZC32 967 aa24.3■■□□□ 1.48
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ODC1-201ENST00000234111 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.3■■□□□ 1.48
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ODC1-201ENST00000234111 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.22■■□□□ 1.47
ODC1-201ENST00000234111 BANK1Q8NDB2 785 aa24.22■■□□□ 1.47
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ODC1-201ENST00000234111 TUBB4BP68371 445 aa24.21■■□□□ 1.47
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ODC1-201ENST00000234111 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.21■■□□□ 1.47
ODC1-201ENST00000234111 TUBB2AQ13885 445 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PANX2Q96RD6 677 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 FAM169AQ9Y6X4 670 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.2■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1AP38606 617 aa24.19■■□□□ 1.46
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