RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 CPLX1O14810 134 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 SYKP43405 635 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 PLA2G4AP47712 749 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC12Q96J65 1359 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 BIN1O00499 593 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 NPHP1O15259 732 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 PRC1O43663 620 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPINC1P01008 464 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA7Q8NI08 942 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.3■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 M0R2C6 588 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 OLFM4Q6UX06 510 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 CHST3Q7LGC8 479 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ITGB4P16144 1822 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 TJP1Q07157 1748 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0G2JLW4 131 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 EYA2O00167 538 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 CDKL5O76039 1030 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC20A2Q08357 652 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP100Q494V2 611 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ST7Q9NRC1 585 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOC5O00471 708 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP1A3P13637 1013 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 OSBP2Q969R2 916 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 TSPYL1Q9H0U9 437 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO3Q9UK99 471 aa26.27■■□□□ 1.8
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF28PB7ZC32 967 aa26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TIMM10P62072 90 aa26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TULP2O00295 520 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 STX10O60499 249 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 RESP18Q5W5W9 173 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1B0GUL7 405 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 STARD3NLO95772 234 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP3K9P80192 1104 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM139Q8IV31 216 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ZMYM6O95789 1325 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 CUTAO60888 179 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 MYH7P12883 1935 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 PPFIA3O75145 1194 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 CARD6Q9BX69 1037 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 LRP6O75581 1613 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 BCL9O00512 1426 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 FGAP02671 866 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPAQ15257 358 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 APPBP2Q92624 585 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ERICH4A6NGS2 130 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 FOXP2O15409 715 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 CASQ1P31415 396 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ANTXR2P58335 489 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 GPS2Q13227 327 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TCIRG1Q13488 830 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 GORABQ5T7V8 394 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC102BQ68D86 513 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 SHC4Q6S5L8 630 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 DPF2Q92785 391 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 RABGGTAQ92696 567 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM51Q9NW97 253 aa26.22■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS37DQ86XT2 251 aa26.21■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ANKRD54-201ENST00000215941 PHLPP1O60346 1717 aa26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms