RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Stox1B2RQL2 990 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Myl1P05977 188 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dtx3lQ3UIR3 748 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nxf2Q4ZGD8 691 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kcnf1Q7TSH7 493 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nlrp10Q8CCN1 673 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Thumpd2Q9CZB3 528 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spef2Q8C9J3 1734 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tcp10bE9PYJ0 438 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cd22P35329 862 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ankrd53Q3V0J4 497 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dhx37Q6NZL1 1150 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Clec16aQ80U30 1036 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trim29Q8R2Q0 587 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trim11Q99PQ2 467 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rufy3Q9D394 469 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dydc1Q9D9T0 175 aa10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Prrt4B2RU40 902 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Stat1P42225 749 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mapk1P63085 358 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pfkfb2P70265 519 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 NxnP97346 435 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zfp51Q3U4L8 781 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm4981Q3ULJ8 291 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 EspnlQ3UYR4 1005 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Prdm4Q80V63 803 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rassf3Q99P51 232 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Galnt15Q9D2N8 638 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Jph3Q9ET77 744 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hip1rQ9JKY5 1068 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ms4a2P20490 235 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Epas1P97481 874 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Usp48Q3V0C5 1052 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cnpy4Q8BQ47 245 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rgs3Q9DC04 966 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cfap58B2RW38 873 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Abcd1P48410 736 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Btg3P50615 252 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tlr7P58681 1050 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Snx13Q6PHS6 957 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zscan22Q8BGS5 496 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Abcg4Q91WA9 646 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Grpel1Q99LP6 217 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Morc1Q9WVL5 950 aa10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hoxc13P50207 328 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nfe2l1Q61985 741 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ticam2Q8BJQ4 232 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tceanc2Q8R2M0 207 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Eps8l3Q91WL0 600 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rassf1Q99MK9 340 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mmel1Q9JLI3 765 aa10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cyp2d11P24457 504 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nedd1P33215 660 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Yap1P46938 488 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lzts1P60853 599 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gjb2Q00977 226 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hvcn1Q3U2S8 269 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Map10Q8BJS7 891 aa10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dthd1E9PZX1 795 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cfap73J3QPZ5 306 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Atp8b2P98199 1209 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Togaram2Q3TYG6 1002 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cpa6Q5U901 438 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zpr1Q62384 459 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tsr2Q8C8T8 191 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Wdr24Q8CFJ9 790 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Sptlc1O35704 473 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mx1P09922 631 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Impdh2P24547 514 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 MsnP26041 577 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 GapdhsQ64467 440 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Unc5dQ8K1S2 956 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q922M7 232 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccdc94Q9D6J3 314 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 IgtpQ9DCE9 423 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lamb3Q61087 1168 aa10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Capn3Q64691 821 aa10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trim17Q7TPM3 477 aa10.44□□□□□ -0.74
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms