RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Col11a2Q64739 1736 aa24.2■■□□□ 1.47
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tlr8P58682 1032 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PcQ05920 1178 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myl10Q62082 202 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ttc12Q8BW49 704 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc14a2Q8R4T9 930 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 TnmdQ9EP64 317 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pla2g12bQ99P27 195 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Letm1Q9Z2I0 738 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myh13B1AR69 1938 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mtx1P47802 317 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Foxp1P58462 705 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dynll1P63168 89 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam170aQ66LM6 333 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 9230110C19RikQ8CC70 267 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc173A0JLY1 547 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cdca8Q8BHX3 289 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ttc27Q8CD92 847 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fez1Q8K0X8 392 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif3aP28741 701 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccdc162pQ0VG85 912 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cypt2Q6P924 180 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Bap1Q99PU7 728 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slfn1Q9Z0I7 337 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ltn1Q6A009 1767 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Bnip3O55003 187 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Usp25P57080 1055 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Llgl2Q3TJ91 1027 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Snx13Q6PHS6 957 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Strip1Q8C079 837 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cnpy3Q9DAU1 276 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 WtapQ9ER69 396 aa24.17■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tnni2P13412 182 aa24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Erich6bQ9D4S6 220 aa24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Suclg2Q9Z2I8 433 aa24.16■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tyro3P55144 880 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam83bQ0VBM2 1012 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 HelbQ6NVF4 1074 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slitrk3Q810B9 980 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Terb1Q8C0V1 768 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 MlphQ91V27 590 aa24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mctp1E9PV86 951 aa24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm28047Q3US59 414 aa24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ehmt1Q5DW34 1296 aa24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ccer1Q9CQL2 403 aa24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adgra3Q7TT36 1310 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ubap1lG3UW59 384 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Spg7Q3ULF4 781 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gpatch3Q8BIY1 525 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Efcc1Q9JJF6 558 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Esyt2Q3TZZ7 845 aa24.13■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NsmfQ99NF2 532 aa24.13■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1700018B08RikQ9DA83 213 aa24.13■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Clic4Q9QYB1 253 aa24.13■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NfixP70257 488 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sec23aQ01405 765 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slurp2P0DP59 97 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Otop3Q80UF9 577 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prkag3Q8BGM7 489 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lrrc2Q8VDB8 371 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tulp1Q9Z273 543 aa24.12■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dock5B2RY04 1868 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Bend4P86174 541 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Acnat2Q8BGG9 420 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Stk38Q91VJ4 465 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pet2A2AHY8 747 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rtn1Q8K0T0 780 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Akt1s1Q9D1F4 257 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zkscan7E9PVW1 718 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vars2Q3U2A8 1060 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ell2Q3UKU1 639 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kif22Q3V300 660 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sumf1Q8R0F3 372 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Wasf1Q8R5H6 559 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 St5Q924W7 1134 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Col20a1Q923P0 1320 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.6 ms