RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637910.1

ARID1B-233, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 2

Gene ARID1B, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-233	ENST00000637910	TBP	P20226	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C4BPB	P20851	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RCVRN	P35243	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RND3	P61587	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	B2M	P61769	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910		Q6ZR54	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	HBE1	P02100	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	FCER2	P06734	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	PGAM2	P15259	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	OR10J1	P30954	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	SPCS3	P61009	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910		A0A0B4J293	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	APOA1	P02647	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	IL4	P05112	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	PSMB3	P49720	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	MEOX2	P50222	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARID1B-233	ENST00000637910	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	BUB3	O43684	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	PAGE4	O60829	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910		P0C879	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	ETV6	P41212	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	RND2	P52198	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	PPP5C	P53041	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	EMP1	P54849	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	CCL18	P55774	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	PIGP	P57054	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	DAD1	P61803	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	DHODH	Q02127	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910		U3KQ87	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	ISLR	O14498	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	GABARAP	O95166	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-233	ENST00000637910	UCP1	P25874	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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