RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 NQO2P16083 231 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 TFPI2P48307 235 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 SRPXP78539 464 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 ST3GAL4Q11206 333 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 C18orf15Q96N68 181 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 GINS3Q9BRX5 216 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 COMMD9Q9P000 198 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 RAB22AQ9UL26 194 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP3-210ENST00000619785 XKRY2A2RUG3 117 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 SCGNO76038 276 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 OR13C7P0DN81 318 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CRYBB3P26998 211 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ARL6IP1Q15041 203 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ZFP69Q49AA0 526 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 Q5VSD8 79 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CNIH2Q6PI25 160 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.02□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CIB2O75838 187 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CRHBPP24387 322 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 GNRHRP30968 328 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 RAB11BQ15907 218 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CACNG5Q9UF02 275 aa5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 H3BMM0 161 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 MYL12BO14950 172 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 GADD45AP24522 165 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 Q56UQ5 140 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 HACD4Q5VWC8 232 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 BEST4Q8NFU0 473 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 UPK3BQ9BT76 320 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 Q9H3A6 140 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 HRASLSQ9HDD0 168 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CLEC5AQ9NY25 188 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 SPATA2Q9UM82 520 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 RFNGQ9Y644 331 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 FAT3Q8TDW7 4589 aa5□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 A0A1B0GU03 582 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 KNCNA6PVL3 124 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 A8MTW9 85 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ARL6IP5O75915 188 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ZNF688P0C7X2 276 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 HLA-DRB4P13762 266 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CLDN12P56749 244 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 RCN1Q15293 331 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 TRAM1Q15629 374 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 CNPY1Q3B7I2 92 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 ZNF709Q8N972 641 aa4.99□□□□□ -1.61
SENP3-210ENST00000619785 FRZBQ92765 325 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms