RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 BMPERQ8N8U9 685 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ZMAT4Q9H898 229 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LCN12Q6JVE5 192 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CD177Q8N6Q3 437 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 RASL10AQ92737 203 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SEC16AO15027 2179 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 GGNQ86UU5 652 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MXK9 166 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 XCL2Q9UBD3 114 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 OOSP1A8MZH6 123 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WWL8 130 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01619G3V211 115 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ITGB1BP1O14713 200 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TNFSF13O75888 250 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PPBPP02775 128 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TCRAP04437 139 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ESPL1Q14674 2120 aa7.11□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 THADAQ6YHU6 1953 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GWJ7 208 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF138P52744 262 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8TAT8 98 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NRN1Q9NPD7 142 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PARP14Q460N5 1801 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12BA1L429 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SRRM5B3KS81 715 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 OVOL3O00110 214 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ATXN8Q156A1 80 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NABP1Q96AH0 204 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SERF1AO75920 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NPSP0C0P6 89 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MST1P26927 711 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 GAFA1Q96PS6 74 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.1□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PRE2 83 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CLPSP04118 112 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00477Q96M19 166 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CR1LQ2VPA4 569 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C1QL4Q86Z23 238 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ERG28Q9UKR5 140 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 E7EQL1 145 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 H0YJW9 148 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE13Q4V321 117 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM126AQ9H061 195 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CSTL1Q9H114 145 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 F8VVB4 439 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 F8VWA3 439 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 K7ENP7 123 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.09□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SH2D1AO60880 128 aa7.09□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PRTN3P24158 256 aa7.09□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.09□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 OCC1Q8TAD7 63 aa7.09□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.09□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SHISA3A0PJX4 238 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms