RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBX15Q96SF7 602 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCRAP04437 139 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCL1AP56279 114 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR5R1Q8NH85 324 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF125Q96EQ8 232 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BRN7 92 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOSR1O95249 250 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRISP2P16562 243 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDPQ00604 133 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUDT11Q96G61 164 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCGB2A1O75556 95 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMY1AP04745 511 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL4P05112 153 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MBD6Q96DN6 1003 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00587B1AMM8 73 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H3BTX0 84 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q8N9W7 124 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITPR1Q14643 2758 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPINK4O60575 86 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HLA-DRB1P01911 266 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q56UQ5 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRR27Q6MZM9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASL11AQ6T310 242 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MLST8Q9BVC4 326 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LTAP01374 205 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HLA-DQA1P01909 254 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAA4P35542 130 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM168AQ92567 244 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV4-39P01824 125 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC35B1P78383 322 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AJUBAQ96IF1 538 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GZMBP10144 247 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB4BP61018 213 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q0VG73 95 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSKUQ8WUA8 353 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SGK494Q96LW2 274 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TXN2Q99757 166 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF492Q9P255 531 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 S4R3C0 116 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TACC2O95359 2948 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPFFO15130 113 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFB8O95169 186 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLC2P0DOY2 106 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR2J3O76001 311 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAGE3Q86Y29 109 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1B0GUS0 222 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F8W735 103 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ESDP10768 282 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAFAH1B2P68402 229 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTAG1AP78358 180 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CT83Q5H943 113 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP35Q8NFH5 326 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 K7EQM0 130 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUPR1O60356 82 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 P01737 135 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 S100A7P31151 101 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TPPP2P59282 170 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms