RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 A0A0G2JRQ6 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HELTA6NFD8 242 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 H3BMM0 161 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SNAPC5O75971 98 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM50AO95807 157 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1-17P01599 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1-5P01602 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PRM2P04554 102 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HLA-DRB4P13762 266 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 NPY1RP25929 384 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RPL5P46777 297 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SSTP61278 116 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HERV-K104P61576 105 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 DHRS2Q13268 280 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RGS21Q2M5E4 152 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PRSS48Q7RTY5 328 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ENKURQ8TC29 256 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 MOB3AQ96BX8 217 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 METTL26Q96S19 204 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RNF167Q9H6Y7 350 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SCN3BQ9NY72 215 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 EHFQ9NZC4 300 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PRNDQ9UKY0 176 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ANAPC10Q9UM13 185 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 EPM2AB3EWF7 344 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 F6UB75 175 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TSC22D2O75157 780 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 CLN5O75503 358 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SCGB1D1O95968 90 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PMP2P02689 132 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 CD5P06127 495 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 P0C879 139 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 IGLC1P0CG04 106 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ELK1P19419 428 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 NPPCP23582 126 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 NPBWR1P48145 328 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 XGP55808 180 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HAMPP81172 84 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 MXD1Q05195 221 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 Q5VSD8 79 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 GPR141Q7Z602 305 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TPRA1Q86W33 373 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 BORCS5Q969J3 196 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 GPR146Q96CH1 333 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 FAM210BQ96KR6 192 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 Q9H521 79 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RFNGQ9Y644 331 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RNF213Q63HN8 5207 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 A0A0B4J293 547 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 A0A1W2PS18 150 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM189A5PLL7 270 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC160A6NGH7 325 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRM-206ENST00000578093 SOCS3O14543 225 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 BUB3O43684 328 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SCGNO76038 276 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 IL4P05112 153 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 SDC2P34741 201 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HRH1P35367 487 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRM-206ENST00000578093 OPRK1P41145 380 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HSPA13P48723 471 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RORCP51449 518 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 RND2P52198 227 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 VBP1P61758 197 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 DAD1P61803 113 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 DLK1P80370 383 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 DHODHQ02127 395 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 OXA1LQ15070 435 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF79Q15937 498 aa2.73□□□□□ -1.97
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