RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OCC1Q8TAD7 63 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM141Q96I45 108 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 F5P12259 2224 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GUS0 222 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 PYYP10082 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 COL8A2P25067 703 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 S4R3C0 116 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-208ENST00000550358 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 GZMBP10144 247 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 PROK2Q9HC23 129 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM89A2RUT3 159 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 K7EMI3 77 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 HTN3P15516 51 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 Q8NFD4 153 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.87□□□□□ -1.31
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