RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 VGLL1Q99990 258 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 U3KQK5 164 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 hADV38S2A0JD32 116 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 GNG7O60262 68 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LYZL6O75951 148 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-7P01780 117 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 GP9P14770 177 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TAL2Q16559 108 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 C3AR1Q16581 482 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ORMDL3Q8N138 153 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 VSTM5A8MXK1 200 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGLV1-44P01699 117 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-13P01766 116 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CRYGCP07315 174 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ORM2P19652 201 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ZNF138P52744 262 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MLANAQ16655 118 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SPATA25Q9BR10 227 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SNAI2O43623 268 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LHBP01229 141 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ZNF883P0CG24 379 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CACNG7P62955 275 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SCGB2A2Q13296 93 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MDS2Q8NDY4 140 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LEAP2Q969E1 77 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 RAB37Q96AX2 223 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PRELID3AQ96N28 172 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 HES7Q9BYE0 225 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 NCR2O95944 276 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1-16P04430 117 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CECR9P0C854 216 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 GATA4P43694 442 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LPAL2Q16609 132 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ACP1P24666 158 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CD24P25063 80 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 COL8A2P25067 703 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 NMUP48645 174 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PLGLAQ15195 96 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PRNTQ86SH4 94 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 RNF7Q9UBF6 113 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 CACNA1DQ01668 2161 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ATP5LO75964 103 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MC5RP33032 325 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 WT1-ASQ06250 92 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 MRAP2Q96G30 205 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 TM2D2Q9BX73 214 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 DKK4Q9UBT3 224 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-215ENST00000537304 PLAUP00749 431 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 GCSHP23434 173 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms