RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 WIPF1O43516 503 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGLL5B9A064 214 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC179H3BU77 68 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 J3QT63 122 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGHG3P01860 377 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PRTN3P24158 256 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00596Q86U02 117 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 UBALD1Q8TB05 177 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 HIGD1BQ9P298 99 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ATMQ13315 3056 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf62A8K5M9 175 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 K7ERJ3 54 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A10P0DMU9 189 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TREML4Q6UXN2 200 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZT83 130 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TEX29Q8N6K0 151 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PRELID3AQ96N28 172 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MGST2Q99735 147 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 DUSP13Q9UII6 198 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PTPRBP23467 1997 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MGST3O14880 152 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GRPP07492 148 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 G6PCP35575 357 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CAMPP49913 170 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PSG5Q15238 335 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 EFNB3Q15768 340 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NFE4Q86UQ8 179 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PTH2Q96A98 100 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CADP27708 2225 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 DYSFO75923 2080 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GWB2 263 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 HIGD1CA8MV81 97 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 RHODO00212 210 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FOXH1O75593 365 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 OR2H2O95918 312 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FOXF2Q12947 444 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MIC13Q5XKP0 118 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MPV17P39210 176 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 Q6P435 159 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 PCP2Q8IVA1 136 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 A8MWL6 223 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 GCSHP23434 173 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 HBBP68871 147 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 TM4SF20Q53R12 229 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 NRGNQ92686 78 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 FZR1Q9UM11 496 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 C16orf97H3BN30 126 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 AMTNQ6UX39 209 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 GLMPQ8WWB7 406 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 GGTLC3B5MD39 225 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 FNDC10F2Z333 226 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 RBP4P02753 201 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 ERVK11-1P61568 191 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 VCX2Q9H322 139 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-209ENST00000519674 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.82□□□□□ -1.32
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