RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf42Q9H799 3197 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA12P43365 314 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM7Q96QT4 1865 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC13A5PLN9 417 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 A8MT66 165 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF682O95780 498 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 CRPP02741 224 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 C8GP07360 202 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 HTR1AP08908 422 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 PPIBP23284 216 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
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PTPRC-212ENST00000491302 DEFB128Q7Z7B8 93 aa2.91□□□□□ -1.94
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PTPRC-212ENST00000491302 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 YIPF3Q9GZM5 350 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 QRICH2Q9H0J4 1663 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 EPG5Q9HCE0 2579 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 BTAF1O14981 1849 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF10O15013 1369 aa2.9□□□□□ -1.94
PTPRC-212ENST00000491302 USP34Q70CQ2 3546 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 NHSQ6T4R5 1651 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0D9SG52 128 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CLPSP04118 112 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 Q1T7F1 81 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf50Q96LR7 162 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 UQCC1Q9NVA1 299 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CLIP1P30622 1438 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 MYH11P35749 1972 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-212ENST00000491302 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-212ENST00000491302 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 LCN15Q6UWW0 184 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 PSTPIP2Q9H939 334 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-212ENST00000491302 RIC1Q4ADV7 1423 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 FUOMA2VDF0 154 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf84I3L1E1 186 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TCL1BO95988 128 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF439Q8NDP4 499 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 Q96M85 177 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A5P29400 1685 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TONSLQ96HA7 1378 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 BRWD1Q9NSI6 2320 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 J3QRK9 145 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR2J2O76002 312 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA1P01009 418 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CST2P09228 141 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 COX6A1P12074 109 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CASP1P29466 404 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CAPZBP47756 277 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 NNATQ16517 81 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 KHDC3LQ587J8 217 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 USP54Q70EL1 1684 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF292O60281 2723 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 KIF1AQ12756 1690 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR2B3O76000 313 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00471Q8N535 108 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.86□□□□□ -1.95
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