RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGSF23A1L1A6 192 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ARPC5O15511 151 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MED6O75586 246 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DEDDO75618 318 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR2J3O76001 311 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CST7O76096 145 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-23P01764 117 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RLN2P04090 185 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA4P05014 189 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CAV2P51636 162 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 STPG2Q8N412 459 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR52E5Q8NH55 327 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01006Q8NI28 216 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM8Q96KF7 97 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR5B12Q96R08 314 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 P2RX4Q99571 388 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 JMJD1CQ15652 2540 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087X0K7 114 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFAF8A1L188 74 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PSMB11A5LHX3 300 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 E5RGE8 158 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CCL24O00175 119 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-11P01762 117 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV3P03979 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGF1P05019 195 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR8U8P0C7N1 319 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CD28P10747 220 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CTRB1P17538 263 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NPY1RP25929 384 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-3P60369 221 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RHOGP84095 191 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF546Q86UE3 836 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00479Q96M42 142 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RAB40CQ96S21 281 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0J9YWU9 116 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SMCO3A2RU48 225 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RNF222A6NCQ9 220 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MT-CO2P00403 227 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV12-3P01733 135 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CRYGCP07315 174 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A4P12235 298 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL2P19875 107 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OPRK1P41145 380 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 HTR2BP41595 481 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 P2RY1P47900 373 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RAB9AP51151 201 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TPPP2P59282 170 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RAB11AP62491 216 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35B1P78383 322 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FGL1Q08830 312 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CLINT1Q14677 625 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OPCMLQ14982 345 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf32Q32M92 178 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 BSXQ3C1V8 233 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf83Q53S99 150 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TCTE3Q8IZS6 198 aa3.6□□□□□ -1.83
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