RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TCL1BO95988 128 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF726P1Q15940 193 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TRGV9Q99603 122 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A45Q8N413 288 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 OTORQ9NRC9 128 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 DKK2Q9UBU2 259 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 RP1P56715 2156 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LYPD3O95274 346 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CD70P32970 193 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS9O00182 355 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LYZP61626 148 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LAGE3Q14657 143 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 EFNB3Q15768 340 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZIC1Q15915 447 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PIGYQ3MUY2 71 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LAMB1P07942 1786 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SNED1Q8TER0 1413 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFC1O43677 76 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A16P16260 332 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2BP63146 152 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FOXQ1Q9C009 403 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZMAT4Q9H898 229 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SIPA1L1O43166 1804 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TEX22C9J3V5 150 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 K7ESM1 405 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 WNT9BO14905 357 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 STARD5Q9NSY2 213 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 H3BS24 57 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFS5O43920 106 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R17O96001 155 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN14O95500 239 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 LTAP01374 205 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FGF12P61328 243 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 Q9H3A6 140 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PIK3C2AO00443 1686 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.53□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 C15orf62A8K5M9 175 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DLL1O00548 723 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ZIC3O60481 467 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PEAK1Q9H792 1746 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFS7O75251 213 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CXCL12P48061 93 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 HAMPP81172 84 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PAX8Q06710 450 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01590Q5TEZ4 76 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 SCN2AQ99250 2005 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 MIA3Q5JRA6 1907 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 MCM3APO60318 1980 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CYYR1Q96J86 154 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 Q96M66 194 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CRYGAP11844 174 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 FAM53BQ14153 422 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 RHOHQ15669 191 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TM2D1Q9BX74 207 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IGHMP01871 453 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IL9P15248 144 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 RASL10AQ92737 203 aa4.51□□□□□ -1.69
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