RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CARD19Q96LW7 228 aa8.77□□□□□ -1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.77□□□□□ -1
APOBEC3C-201ENST00000361441 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 KNTC1P50748 2209 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q0VFX4 171 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N7P7 452 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.77□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIGD1CA8MV81 97 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRLF1O75462 422 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 GCHFRP30047 84 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF137PP52743 207 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 LPAL2Q16609 132 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZSR3 168 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUSP13Q9UII6 198 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 F5H768 121 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNCGO76070 127 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF747Q9BV97 191 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZG16O60844 167 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CA6P23280 308 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIC13Q5XKP0 118 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASL11AQ6T310 242 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCSK4Q6UW60 755 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf52Q96A22 123 aa8.76□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 USF3Q68DE3 2245 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCSK5Q92824 1860 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SFTA2Q6UW10 78 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZQT7 251 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM126AQ9H061 195 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-8P01709 118 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 THBDP07204 575 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FGF12P61328 243 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZS49 121 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAP25Q8TEE9 199 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNG7P62955 275 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MKXQ8IYA7 352 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGST3O14880 152 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYOD1P15172 320 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOLR3P41439 243 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXCL12P48061 93 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MEOX1P50221 254 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUX5Q96PT3 197 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MOSP00540 346 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF688P0C7X2 276 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASL10AQ92737 203 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBXL15Q9H469 300 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-13P01766 116 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 C12orf74Q32Q52 190 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00479Q96M42 142 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV2-14P01704 120 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEND1Q8N111 149 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FGFRL1Q8N441 504 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 SVILO95425 2214 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCBD1P61457 104 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIR2DS1Q14954 304 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPEQ96AT9 228 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACTL6BO94805 426 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACP1P24666 158 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FCER1GP30273 86 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 FXYD7P58549 80 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERVK11-1P61568 191 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms