RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000095500.4

Ccdc78-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc78, Length 1,651 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Fam216bQ8CC14 138 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nabp2Q8R2Y9 212 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr1501Q8VFQ3 315 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tram1Q91V04 374 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 HpxQ91X72 460 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Dnajc24Q91ZF0 196 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 H2afb1Q9CQ70 111 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 GlrxQ9QUH0 107 aa8.7□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ighv1-13A0A075B5I0 98 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 AsmtD3KU66 387 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Spint5J3KMK8 105 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm21882J3QN86 361 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm8356J3QPD3 205 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Speer4eK7N6S8 255 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cited2O35740 269 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 H2-Ab1P01921 265 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Saa1P05366 122 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CrpP14847 225 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gpr12P35412 334 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Klhl8P59280 629 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn1r15Q14C10 299 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Oosp2Q4FZG8 168 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Lhfpl5Q4KL25 219 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Taar5Q5QD14 337 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sox19Q62249 55 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm17334Q8C6U3 126 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm9958Q8C9U4 106 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ubac2Q8R1K1 345 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Uxs1Q91XL3 420 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr101Q920Z0 308 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rwdd2bQ99M03 290 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rpl15Q9CZM2 204 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pygo1Q9D0P5 417 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cx3cr1Q9Z0D9 354 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pm20d2A3KG59 431 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm8126E9Q1N7 198 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp820E9Q5G8 549 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr628K7N6B2 316 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rbbp9O88851 186 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 KrasP32883 189 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CluQ06890 448 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Prss34Q80UR4 318 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 GaptQ8CB93 157 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cmtm3Q99LJ5 184 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 OcstampQ9D611 498 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cldnd2Q9D9H2 167 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gpr34Q9R1K6 375 aa8.69□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm29049A0A087WSM5 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rhox7aA2A4F1 281 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr427E9Q7E7 315 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm8220F6YKI2 213 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm21118J3QPK8 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ifna4P07351 186 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rab3cP62823 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 KncnQ307W7 124 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Q3U595 105 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm10188Q3V432 135 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Wfdc8Q4KUS1 273 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20909Q5FWB5 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20852Q5M8R5 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gnb3Q61011 340 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20917Q62457 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20809Q62458 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20865Q62460 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rsl1Q7M6Y1 485 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20738Q810R8 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Fam169bQ8CHT6 337 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cmtm4Q8CJ61 208 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cmc2Q8K199 79 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 IdnkQ8R0J8 184 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr1280Q8VGG8 305 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Prr15Q9D1T5 122 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 S100a16Q9D708 124 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cox20Q9D7J4 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20806Q9D9T3 227 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Calm4Q9JM83 148 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sumo3Q9Z172 110 aa8.68□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Arl16B1ATY8 173 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm17657E9PWY5 170 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ifna1P01572 189 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 P01806 116 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Lynx1P0DP60 116 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rag2P21784 527 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hes1P35428 282 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rplp1P47955 114 aa8.67□□□□□ -1.02
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 PpoxP51175 477 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 78.4 ms