RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P18530 117 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TaglnP37804 201 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc30P59041 219 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gng2P63213 71 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc39a7Q31125 476 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glt8d1Q6NSU3 371 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr139Q80UC8 345 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a29Q8BWG6 551 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Parp11Q8CFF0 331 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr495Q8VF12 330 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr736Q8VFT6 312 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr508Q8VG42 310 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr346Q8VGJ7 309 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2e2Q91W82 201 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FrkQ922K9 512 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35b3Q922Q5 369 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Raet1eQ9CZQ6 251 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl26Q9DCS2 204 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn10Q9Z0S6 231 aa8.65□□□□□ -1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pm20d2A3KG59 431 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl16B1ATY8 173 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 E130114P18RikF6S0S7 154 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr23a1G3UW32 258 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1221L7MU53 311 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca11O70354 328 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtatp6P00848 226 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01812 117 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ucp1P12242 307 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HexbP20060 536 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wnt10aP70701 417 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il31Q6EAL8 163 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usmg5Q78IK2 58 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Upk3bQ80YF6 275 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cept1Q8BGS7 416 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DpcdQ8BPA8 203 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc1a7Q8JZR4 559 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phf13Q8K2W6 296 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shisa2Q8QZV2 295 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sectm1bQ9JL59 212 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LitafQ9JLJ0 161 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab9aQ9R0M6 201 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa8.64□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-55A0A075B5W6 117 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem29A2ANF5 204 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm572B1ARY8 399 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3327F7C9A1 213 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8229K7N749 213 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnih2O35089 160 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a17O70579 307 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01658 132 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fcer1gP20491 86 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a9P28571 692 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KrasP32883 189 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspb7P35385 169 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnb1P62874 340 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gng8P63078 70 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r15Q14C10 299 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctxn2Q3URE8 81 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mef2aQ60929 498 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1137Q7TR40 310 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem127Q8BGP5 238 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnah3Q8BW94 4083 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kmt2aP55200 3966 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4931422A03RikA2BHN9 113 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adap1E9PY16 374 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr177E9Q7W1 309 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DhodhO35435 395 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q32P12 615 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3U595 105 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MffQ6PCP5 291 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc36Q6PDM4 574 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr901Q7TRD1 311 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr137Q80ZU9 396 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tm2d3Q8BJ83 261 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap22Q8BL80 702 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mitd1Q8VDV8 249 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ms4a4dQ99N05 225 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr15Q9D1T5 122 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2al3Q9D4U4 128 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il36bQ9D6Z6 183 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptges3lQ9D9A7 131 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf580Q9DB38 172 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tinf2Q9QXG9 341 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sumo3Q9Z172 110 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ApomQ9Z1R3 190 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1247A2AT78 314 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.4 ms