Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZQ6

Raet1e, Retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raet1eQ9CZQ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Raet1eQ9CZQ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Raet1eQ9CZQ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Raet1eQ9CZQ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Raet1eQ9CZQ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Raet1eQ9CZQ6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Raet1eQ9CZQ6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Raet1eQ9CZQ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Raet1eQ9CZQ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Raet1eQ9CZQ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Raet1eQ9CZQ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Raet1eQ9CZQ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Raet1eQ9CZQ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Raet1eQ9CZQ6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Raet1eQ9CZQ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Raet1eQ9CZQ6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Raet1eQ9CZQ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Raet1eQ9CZQ6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Raet1eQ9CZQ6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Raet1eQ9CZQ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Raet1eQ9CZQ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Raet1eQ9CZQ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Raet1eQ9CZQ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Raet1eQ9CZQ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Raet1eQ9CZQ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Raet1eQ9CZQ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Raet1eQ9CZQ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Raet1eQ9CZQ6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Raet1eQ9CZQ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Raet1eQ9CZQ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Raet1eQ9CZQ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Raet1eQ9CZQ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Raet1eQ9CZQ6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Raet1eQ9CZQ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Raet1eQ9CZQ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Raet1eQ9CZQ6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Raet1eQ9CZQ6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Raet1eQ9CZQ6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Raet1eQ9CZQ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Raet1eQ9CZQ6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Raet1eQ9CZQ6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Raet1eQ9CZQ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Raet1eQ9CZQ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Raet1eQ9CZQ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Raet1eQ9CZQ6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Raet1eQ9CZQ6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Raet1eQ9CZQ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Raet1eQ9CZQ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Raet1eQ9CZQ6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Raet1eQ9CZQ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Raet1eQ9CZQ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Raet1eQ9CZQ6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Raet1eQ9CZQ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Raet1eQ9CZQ6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Raet1eQ9CZQ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Raet1eQ9CZQ6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Raet1eQ9CZQ6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Raet1eQ9CZQ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Raet1eQ9CZQ6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Raet1eQ9CZQ6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Raet1eQ9CZQ6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Raet1eQ9CZQ6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Raet1eQ9CZQ6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Raet1eQ9CZQ6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Raet1eQ9CZQ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Raet1eQ9CZQ6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Raet1eQ9CZQ6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Raet1eQ9CZQ6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Raet1eQ9CZQ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Raet1eQ9CZQ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Raet1eQ9CZQ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Raet1eQ9CZQ6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Raet1eQ9CZQ6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Raet1eQ9CZQ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Raet1eQ9CZQ6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Raet1eQ9CZQ6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Raet1eQ9CZQ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Raet1eQ9CZQ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Raet1eQ9CZQ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Raet1eQ9CZQ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Raet1eQ9CZQ6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Raet1eQ9CZQ6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Raet1eQ9CZQ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Raet1eQ9CZQ6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Raet1eQ9CZQ6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Raet1eQ9CZQ6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raet1eQ9CZQ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Raet1eQ9CZQ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Raet1eQ9CZQ6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Raet1eQ9CZQ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Raet1eQ9CZQ6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Raet1eQ9CZQ6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Raet1eQ9CZQ6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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